¿Cómo es la nueva variante hallada en Sudáfrica? Mutaciones nunca vistas antes y una positividad del 1 al 30% en sólo tres semanas

Casos en aumento en el país con tasas de positividad del 1 al 30% en tan sólo tres semanas. Mutaciones nunca antes vistas y otras asociadas en el pasado a una mayor transmisibilidad y evasión inmunitaria. Así es la nueva variante descubierta en Sudáfrica

El Instituto Nacional de Enfermedades Transmisibles (NICD), una división del Servicio Nacional de Laboratorio de Salud (NHLS) en Sudáfrica, ha confirmado que se ha detectado una nueva variante del coronavirus identificada como B.1.1.529 . Otros laboratorios están confirmando casos en aumento a medida que salen los resultados de la secuenciación.

CRECIMIENTO SIGNIFICATIVO

Los casos detectados y el porcentaje de resultados positivos están aumentando rápidamente, especialmente en Gauteng (una zona urbana que incluye Pretoria y Johannesburgo), pero también en el noroeste del país y en Limpopo. Las tasas de positividad de Tshwane (parte de Guateng) han aumentado en las últimas 3 semanas de menos del 1% a más del 30%.
Así es como se está extendiendo la nueva variante en Sudáfrica: en el siguiente gráfico (del NHLS) están representadas las variantes generalizadas en el país desde el inicio de la pandemia. El gris claro representa muchos tipos diferentes de virus característicos de la primera ola; en verde la segunda ola caracterizada por la prevalencia de Beta; en rojo la tercera ola de Delta, en amarillo el crecimiento de los casos de la variante C.1.2 (aún detectados, pero no en aumento) y en azul el B.1.1.529 (en aumento muy rápido).

32 MUTACIONES EN LA PROTEÍNA SPIKE

La variante también se detectó en Botswana. No se sabe dónde nació, porque Sudáfrica y Botswana (y Kenia) tienen una capacidad de rastreo y secuenciación genómica superior a otros países africanos. Lo que se sabe hasta ahora es que B.1.1.529 tiene 32 mutaciones en la proteína Spike (la parte del virus que la mayoría de las vacunas usan para activar el sistema inmunológico contra el Covid), mucho más que Beta y Delta combinadas. 

Entre otras se encuentran: K417N, N440KG446SS477NT478K, E484AQ493KG496SQ498RN501YY505H. Algunas mutaciones nunca se han visto, otras son conocidas (las conocemos por variantes y estudios previos) y se han relacionado con la capacidad de una variante para ser más transmisible y escapar de la inmunidad administrada por vacunas. 

Sin embargo, afirman los científicos, las mutaciones a menudo funcionan juntas, por lo que es imposible predecir lo que podría significar esta combinación en particular.

DEMASIADO PRONTO PARA SACAR CONCLUSIONES

La buena noticia es que la variante puede detectarse mediante pruebas de PCR, hisopos moleculares, antes de secuenciar los genomas, gracias a la deleción del gen S 69-70

Los estudios de laboratorio han comenzado a comprender mejor las consecuencias de esta variante en cuanto a transmisibilidad, gravedad, evasión inmune, pero los resultados tardarán entre 2 y 3 semanas. 

Ravi Gupta, profesor de microbiología clínica en la Universidad de Cambridge, dijo que el trabajo en su laboratorio ha encontrado en el pasado que dos de las mutaciones en B.1.1.529 aumentaron la infectividad y redujeron el reconocimiento de anticuerpos.


Miembros de la Organización Mundial de la Salud le darán a la nueva variante un nombre griego, que podría ser ‘Nu’. Hasta el momento la competencia de las nuevas variantes con el Delta ha ido ganando para este último debido a su capacidad de transmisión tan alta que ninguna otra variante ha logrado establecer.

VARIANTE NACIDA DE UN PACIENTE INMUNODEPRIMIDO

Mientras tanto, se fortalecerán las medidas sobre vacunas y equipos de protección en Sudáfrica. Se debate el origen de la nueva variante: Sudáfrica tiene altos niveles de infección, pero tasas de vacunación relativamente bajas (alrededor del 24% se ha vacunado por completo).

Francois Balloux, director del UCL Genetics Institute y profesor de biología computacional en el University College London, dice en un comunicado publicado por el Media Center of Science que es probable que la nueva variante haya evolucionado durante una infección crónica de una persona inmunodeprimida, posiblemente en un paciente con VIH o SIDA sin tratar. 

El altísimo número de casos de VIH ha complicado los esfuerzos de Sudáfrica para combatir la pandemia de coronavirus, ya que las personas inmunodeprimidas pueden albergar el virus durante más tiempo, dijeron los científicos.

El Mundo